一、工程款诉讼时效已过怎么处理
可以通过以下方法进行处理：
1.录音催讨法：
对话主要内容应包含：
（1）对方欠款数额；
（2）施工方自何时以来一直在主张债权；
（3）何时归还工程款。
2.银行转账法：
为了获得证据，施工方可以首先派人去对方单位，对方能给多少就要多少，但是不拿现金，要求从银行走汇票，想方设法恢复诉讼时效。
3.协商对账法：
双方重新签订的联系单、对账单是有效证据。
二、工程款包含哪些内容
1.预付款。预付款指开工前发包人应预付给承包人用于为合同工程施工准备的款项。施工准备事项包括购置材料、工程设备、施工设备、修建临时设施以及组织施工队伍进场等。预付款比例一般不低于合同金额的10%，不高于合同金额的30%；
2.进度款。进度款指施工期间发包人根据工程完成情况应支付给承包人的一种工程价款。在工程实践中，发包人同意支付进度一般为合同价的70%，进度款有三种支付方式：
（1）按形象进度分阶段支付；
（2）是按照已完工程量分期间支付；
（3）是按照阶段及期间混合支付。
3.结算款。结算款，即竣工结算款，指工程竣工结算后发包人应该支付给承包人的除质保金外的剩余工程价款。竣工结算款等于竣工结算价减去质保金和已付款后的金额。竣工结算款支付的前提条件是工程竣工验收合格。
三、工程款纠纷的诉讼时效是多久
3年。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。